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藥物巡禮
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測序技術揭示了種族決定抗體基因差異
時間:2013-04-22 10:40:24 來源:生物探索 點擊:

    包括5位來自Simon Fraser大學在內(nèi)的14位北美科學家,破解了人類基因組上復雜區(qū)域遺傳代碼,從而開拓了免疫學研究的新領域。

    研究人員發(fā)現(xiàn),大量的抗體基因在相互協(xié)調(diào)和對外免疫上確實存在因人而異的現(xiàn)象,這意味著,即便從整個人群角度設計藥物、醫(yī)療方案和疫苗接種,人體對其的反應也可能是不一致的。

    完成對人類基因組上長度達1百萬bp的高度重復的DNA序列(免疫球蛋白重鏈IGH的遺傳位點)測序后,科學家發(fā)現(xiàn)了,種族差異可能會影響免疫力。紐約Mount Sinai 大學醫(yī)學院博士后Corey Watson 研究員稱:“我們發(fā)現(xiàn),IGH遺傳位點的片段在一些人身上發(fā)生缺失現(xiàn)象,而在另一些人身上又出現(xiàn)在基因組上,種族差異決定了該遺傳片段的缺失或存在。”

     科學家們早就知道,作為最高產(chǎn)的DNA重組區(qū),IGH-鏈的遺傳位點提供了50多個具有差異性的編碼抗體的基因,以供人體B細胞防御感染和疾病。

     在新的數(shù)據(jù)分析技術的幫助下,研究人員首次從根本上改善了這項研究,截至到目前,已利用零散片段大致地拼裝了人類基因組IGH-鏈的遺傳圖譜。Watson稱:“由于這是最為完整的人類IGH序列,我們的序列已整合到官方的人類基因組組合項目中(human genome project assembly)。”

     利用個體的單一染色體,最新研究測序了IGH位點上編碼抗體的所有可能的基因類型,同時也發(fā)現(xiàn)了該位點上編碼基因出現(xiàn)了11種遺傳組合形式(較大片段DNA的缺失和插入)。這一情況決定了抗體基因的遺傳多樣性,在某些情況下也關聯(lián)到疾病易感性。
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     在觀察425位來自亞洲、非洲和歐洲后裔的染色體后,圍繞著DNA片段插入和缺失進行研究,科學家發(fā)現(xiàn)了抗體組成與種族之間的關聯(lián)。

     Watson強調(diào)稱:“這項研究表明,過去的歲月中不同的種族人群接觸了特定環(huán)境的病原體,引起了DNA的插入或缺失,從而可能影響了疾病風險。研究結果表明,抗體研究需要考慮到所選取的種族DNA樣本。”

     在這項研究的推動下,科學家將進一步探索與IGH相關的抗體基因差異性如何影響不同人群對病毒(如流感和艾滋病病毒)的防御能力。

文章來源:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929713001122

 

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